海軍官校正期班課程教育含括「大學學系教育」與「海軍專業軍事教育」兩大方面，這些課程的目的，是為學生們未來的海軍軍官生涯預作準備，同時也讓學生具有再進修專業訓練和研究所教育之基礎。經由這些工程科學、自然科學、社會科學、人文科學、軍事專業課程和體育訓練的課程，海軍官校提供的是均衡的全人教育，注重個別潛能的啟迪並開拓未來潛能的發展。

　　海軍官校課程設計秉持航輪兼習、德術兼修並重視學系學術專業的前提，規劃「通識教育」、「學系教育」及「軍事訓練」，畢業修習總學分數為136學分(含)以上(正期115年班)。

一、通識教育

　　國內大學通識教育係源自西方傳統的「博雅教育」，強調全人教育，旨在培養健全的人格，並對生命意義、歷史文化、政治素養和人類前途建立群體的精神價值，而國外博雅教育則強調各種基本能力的養成，本校參考博雅教育的理念及美國海軍官校核心課程的精神，將通識教育之全人化內涵，擴大為全人培育暨海軍基本能力養成，區分「共同必修」及「博雅選修」。

二、學系教育

　   學系課程區分「基礎科學」、「軍事核心」、「海軍工程」及「各學系主修專業課程」等4類，計有海洋科學、船舶機械、電機工程、應用科學、資訊管理及應外系等6個專業學系。

三、訓育課程：

       包括精神教育與德行教育。

四、體育課程：

       為培養學生團隊精神、鍛鍊強健體魄、精練體能戰技，規劃學生體育課程每週授課2小時，區分一般課程與興趣選項課程。

五、暑期訓練：

       除入伍訓練外，各年級依本軍特性分別實施游泳訓練、廠訓、新四項訓練、艦訓及遠航訓練，使學理與實務相互印證，達成畢業後勝任本職工作。

　　士官二專班課程為融匯哲學、科學、兵學於一體之專業教育，使學生在德、智、體、群、美五育均衡發展下，培養健全之海軍專業技術士官。其教育目標在於以培養健全人格與專業技術之海軍專業技術士官，以完整之學識課程及兼具軍民兩種專長之教育為內涵，並輔導考取證照，以精練專業技術能力及奠定爾後進修深造發展潛力，其畢業修習總學分數為80學分(含)以上。

一、學年教育：

　　各科分別設計應修科目，以培養海軍專業技術士官為目標。

二、通識教育：

　　區分人文、社會、自然、軍事及通識教育講座。

三、訓育課程：

　　包括精神教育與德行教育。

四、體育課程：

　　為培養學生團隊精神、鍛鍊強健體魄、精練體能戰技，規劃學生體育課程每週授課2小時，區分一般課程與興趣選項課程。

五、暑期訓練：

　　除入伍訓練外，各年級依本軍特性分別實施游泳訓練、廠訓、新四項訓練、分科實習及環島航訓，使學理與實務相互印證，達成畢業後勝任本職工作。